应用气象学隶属大气科学一级学科。2002年南京信息工程大学气象学二级学科被评为国家重点学科；2008年南京信息工程大学大气科学一级学科被评为江苏省一级重点学科、2011年被评为江苏省高校第一批优势学科，2014年被评为江苏省高校第二批优势学科，2012年教育部第三轮学科评估综合排名位列全国第一。
生态学学科前身为20世纪70年代开展的植物生理学研究，2003年设置专业，2005年获得硕士学位硕士学位授予权，2011年国务院学科调整后具有一级硕士学位授予权，目前是江苏省特色专业建设点。
学科建设成果
序号 | 名称 | 授予（认定）单位 | 时间 |
1 | 国家重点学科 | 教育部 | 2002 |
2 | 全国第三轮学科评估综合排名第一 | 教育部 | 2012 |
3 | 江苏省高校优势学科（第一批） | 江苏省教育厅 | 2011 |
4 | 江苏省高校优势学科（第二批） | 江苏省教育厅 | 2014 |
学位授权点
博士学位授权点 | 0706Z2应用气象学 |
硕士学位授权点 | 0706Z2应用气象学 |
| 071300生态学 | |
| 090300农业资源与环境 | |
| 095100农业（专业学位） |
